Hovedpine hos børn kan have samme årsag som hos voksne.
Hovedpine kan skyldes fastlåstninger i barnets nakke eller ryg forårsaget af fald i forbindelse med sport eller leg. Stress, dårlig siddestilling i skolen eller lignende kan ligeledes være årsagen. Specielt indretning af moderne klasselokaler hvor skoleborderne står i hestesko eller i grupper kan være problematisk. Det betyder at børnene bliver nødt til at sidde og se til den ene side hele tiden for at følge med i undervisningen.
Den meget ensidige siddestilling kan resultere i fastlåsninger i nakke eller ryg og dermed give barnet hovedpine eller koncentrationsbesvær.
Den manuelle behandling af børn er skånsom og uden bivirkninger. Med udgangspunkt i nærvær og tålmodighed bliver behandlingen ofte udført gennem leg med barnet.